HACCP體系須保存的記錄應包括：
1危害分析小結：包括書面的危害分析工作單和用于進行危害分析和建立關鍵限值的任何信息的記錄。支持文件也可以包括：制定抑制細菌性病原體生長的方法時所使用的充足的資料，建立產品安全貨架壽命所使用的資料，以及在確定殺死細菌性病原體加熱強度時所使用的資料。除了數據以外，支持文件也可以包含向有關顧問和專家進行咨詢的信件。
2 HACCP計劃：包括HACCP工作小組名單及相關的責任、產品描述、經確認的生產工藝流程和HACCP小結。HACCP小結應包括產品名稱、CCP所處的步驟和危害的名稱、關鍵限值、監控措施、糾偏措施、驗證程序和保持記錄的程序。
3 HACCP計劃實施過程中發生的所有記錄：GMP、SSOP、檢驗驗收記錄、操作記錄、狀態（時間溫度等）記錄。
4 其他支持性文件例如驗證記錄，包括HACCP計劃的修訂等。