由于青花菜的食用部分是幼嫩的花蕾、花梗和嫩薹，呼吸代謝十分旺盛，因此，不耐儲藏，采收后要及時處理。青花菜花球采收標準是，手感花蕾粒子開始有些松動或花球邊緣的花蕾粒子略有松散時，花球發育到一定大小，一般直徑為15厘米左右，花球表面緊密略平滑、無凹凸時為采收適期。

    一、簡易儲藏保鮮。采用花菜專用袋，用乙烯吸收劑（按果實重的0.1-0.2%）吸收花菜在儲藏過程中釋放的乙烯氣體，可以延緩后熟和衰老。用化學保鮮劑如1%瓜菜保鮮劑、1號保鮮劑、克霉靈處理花球，可防止腐爛。用該法儲藏青花菜兩三個月，商品率仍達95%以上。

    二、藥劑處理保鮮。不論是采前噴6-芐基腺嘌呤溶液還是采后浸6-芐基腺嘌呤溶液，均能延緩青花菜的黃衰。選擇成熟、大小一致的花球，用濃度為40毫克/公斤的6-芐基腺嘌呤溶液噴霧，晾干后用0.04毫米PE薄膜進行單花球包裝，放在塑料筐中，置于冷庫的貨架上，冷庫溫度為1℃±0.5℃，空氣相對濕度為85-95%，可儲藏2個月絕大部分花球仍保持綠色。

    三、薄膜包裝冷藏。包裝青花菜，可用60厘米×32厘米×30厘米的紙板箱，箱內襯入0.04毫米厚的聚乙烯塑料袋，花球裝入后扎口密封，并打兩個小孔。每箱裝青花菜10公斤。青花菜在包裝前須經預冷，儲藏適溫為0℃，相對濕度95%。采收后，立即將青花菜降溫至1℃，并用0.03毫米厚的聚乙烯薄膜對單個花球密封包裝，可儲藏30-45天，保鮮、保綠效果良好，好球率在90%以上。

    四、速凍保藏。速凍時，將花球先行預冷降溫，再清洗，除去表面灰塵、異物和農藥。然后切成小塊，放在濃度為2%的食鹽水池內浸泡10-15分鐘，取出在清水中沖洗，再在95℃以上的沸水中漂燙，撈出立即放入3-5℃的冷水中漂洗冷卻，再撈入竹筐或除水器中瀝凈水。用塑料袋包裝，每袋0.5-1公斤，置瓦楞紙箱內，每箱20-25公斤，送入冷凍機，待其中心溫度達到-18℃時為止。冷凍后將其置于-18℃處保藏。食用前需將其置于冰箱、室內、冰水或溫水中緩慢解凍，然后烹調。

    五、氣調儲藏。10%的二氧化碳、1%的氧氣及5℃溫度下的氣調儲藏，能延長新鮮青花菜的貨架壽命。

    六、防腐儲藏。在儲藏庫內采用煙熏或熏蒸方式防腐，并噴灑濃度為60毫克/升的茶多酚溶液，可防止青花菜褪綠黃化。將青花菜裝入黑色聚乙烯薄膜袋中，將袋口扎緊后進行儲藏，也能延遲轉黃時間。

    七、假植儲藏。在背風向陽處挖一寬0.8米、深1-1.5米的儲藏溝，溝長不限。選擇晚熟品種，將帶有尚未成熟的幼小花球的青花菜植株假植在溝內，用葉子壓住花球。儲藏前期，溝頂晚上加蓋草席，早上揭開，使白天溝內溫度為17-20℃，晚上不低于0℃。后期加蓋塑料薄膜，四周用土壓嚴，白天揭開草席，晚上蓋嚴，使溝內溫度白天維持在1℃，夜間不低于0℃。儲藏時要適時放風、澆水。

    八、冷藏保鮮運輸。運輸青花菜，要求用冷藏車或冷藏集裝箱。裝車前要將箱體溫度降到0℃。裝卸時間要快，運輸過程中箱體內的溫度要嚴格控制在0℃。沒有冷藏儲運設備的，可于采收后及時在包裝箱內加冰塊降溫，加冰量占箱總體積的1/3至2/5，并且要盡快運至目的地。運輸過程中溫度不宜高于4.5℃，否則小花蕾會很快黃化。