秋收種子冬藏是實現來年豐收必須做好的一件重要工作。包括防霉變、防污染、防高溫、防腐蝕、防窒息、防混雜、防煙熏、防蟲鼠等。
 
　　防霉變：關鍵是控制種子本身所含的水分。禾谷類作物種子含水量為１２％—１３％，油料作物種子為８％—９％，若含水量過高，則易發生霉變，尤其是花生、大豆、玉米等含油脂和淀粉較多的作物種子，更應注意。
 
　　防污染：種子貯藏要徹底清除作物莖葉、雜草、砂子、土粒等雜物，并對貯藏室以及貯藏用具進行嚴格的消毒，以免種子在貯藏過程中受到污染。
 
　　防高溫：溫度過高，種子呼吸作用旺盛，會過多消耗自身貯存的營養，降低發芽率，因此要求貯藏種子的環境溫度最好在１０℃左右，切忌把種子放在火爐較近的地方。
 
　　防腐蝕：種子不能與農藥、化肥等同室存放，因許多農藥和化肥具有較強的揮發性，揮發出的氣體對種子細胞和種胚危害極大。
 
　　防窒息：種子不能用塑料袋貯存，因塑料袋不透氣，種子在袋內被迫進行無氧呼吸，產生酒精和有機酸等有毒物質，殺死種胚，使種子失去發芽能力，同時還引起霉變。
 
　　防混雜：不少作物的種子與一般食用糧食不易區分，稍不注意就會造成種、糧混雜，很容易將種子當糧食吃掉，會造成很大的浪費；也很容易把糧食當種子播種，引起嚴重減產。
 
　　防熏煙：種子較長時間受到煙氣熏蒸，會降低種子活性，削弱發芽率。因此煙氣（尤其是煤煙氣，柴草煙氣）較大的房間（例如廚房）不能存放種子，貯藏室也不宜靠近廚房。
 
　　防蟲鼠：害蟲和老鼠不僅直接吃掉種子，而且還會污染種子，使種子變質，降低發芽率。因此，要采取措施消滅害蟲和老鼠。