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雜交水稻施肥原則應是有機肥、磷化肥作基肥，鉀化肥主要作分蘗肥，氮化肥采用多次勻施，特別注意好壯苞、壯籽肥，在足穗的同時，攻大穗大粒。
（1）基肥以有機肥為主
據測定，雜交稻的總吸肥量有50%-60%的氮素和70%的磷、鉀來自土壤，施肥不足就會過多消耗土壤潛在養分而降低地力，增施有機肥是維護和提高地力的重要途徑。因此，雜交稻生產要強調積制土雜肥，發展養殖業多施欄肥、多種綠肥，推廣撩穗收割和稻草還田等，使有機肥施用量占全期施肥量的40%。
（2）適量早施分蘗肥
由于雜交水稻根系活力強，插后新根發生較快，一般早稻在插后5天，晚稻在插后3天，即可追施尿素等促進分蘗，分蘗肥宜分次施用，第一次每畝施尿素6-7.5千克；隔7天左右，根據苗情，對生長差的田塊，補施第二次蘗肥,畝用尿素4千克以內;對施有機肥少和缺鉀肥的田塊,每畝追5-7.5千克鉀肥。
（3）看苗施用穗肥
穗肥因施用時期和作用不同，可分為促花肥和�；ǚ�。凡是前期施肥適當、禾苗長勢平衡的,一般應以�；ㄔ隽橹攸c,只施�；ǚ识沂┯昧坎灰诉^多，一般每畝施用尿素2.5千克左右。如果前期施肥不足，群體苗數偏少，個體長勢效差，那么促花肥與保花肥都可施用，每次每畝可施用尿素5千克。雜交水稻對鉀肥需求量大，曬田復水后結合追施氮肥，每畝追施工2.5千克左右鉀肥，增產效果顯著。
（4）看苗施用粒肥和葉面追肥在始穗前禾苗葉色過淡的，每畝撒施2-2.5千克尿素，齊穗后過早落黃的田，每畝施尿素2.5--3千克，生長正常的雜交稻，只宜用500?750千克尿素兌水50千克噴霧作粒肥。
由于雜交稻后期對磷鉀的吸收量較高，因此后期施葉面肥有良好的增產作用。在始穗前4-6天或齊穗后勤部2-3天用磷酸二氫鉀150-200千克兌水50千克對生長差的禾苗噴施，有增強植株抵抗高溫或低溫的能力。
