水稻遭受洪澇害后的癥狀，在各生育期的表現是不同的。

(1)苗期受淹

秧苗瘦弱細長，腳葉呈黃綠色，水退后有不同程度的倒靡現象，但一般都能恢復生長。

(2)分蘗期受淹

稻株腳葉壞死，呈黃褐色或暗綠色，心葉略有彎曲，水退后有不同程度的葉片干枯，但不致引起腐爛死亡。

(3)拔節期受淹

受澇時正在拔節的節間，隨著淹水天數和淹水深度的增加，節間延長程度愈大。但在水退后，植株節間以上的各節長度，淹水的反而比未淹水的要短。因此，全株高度也隨著淹水愈久而愈短。在嚴重受淹情況下，由于植株體內養分消耗殆盡，在退水后，造成莖桿細弱，出現植株彎曲、折斷以及倒伏后重新翹豎、撓折等畸形現象，這種彎曲莖也因淹水愈久而愈多。

(4)孕穗期受淹

孕穗期間，特別是花粉母細胞減數分裂時期，是水稻一生中對外界環境抵抗能力最弱的時期，對外界不良條件反應極為敏感，此時受淹，會出現爛穗、畸形穗等現象。同時未死亡的幼穗穎花和枝梗退化嚴重，抽穗后白稃多，甚至會出現畸形穗(沒有小穗，只有穗軸)。且抽穗和成熟期推遲5～15天，每穗粒數減少，癟谷增多。由于主莖幼穗傷亡，頂端生長受阻，使稻株地上部莖節的潛伏芽萌發成分枝，這種高節位分枝，一般在水退后2～3天內就會出現。這些分枝如后期溫度高，也能抽穗結實，但由于主莖受澇衰敗，養分供應不足，故每穗粒數減少，結實率很低，最后導致嚴重減產。

(5)灌漿乳熟期受淹

表現腳葉枯萎，頂葉呈黃綠色，谷粒灰色有乳漿，少數谷粒在穗上發芽，千粒重下降，米質變劣，發芽率降低。

水稻后期受澇，空秕粒增加，千粒重下降，莖桿纖細，易倒伏減產。水稻受淹時，水層若不淹沒葉頂，則尚有收成，如淹沒葉頂，則受災嚴重；混濁的水比清澈的水危害重；水流速度大，易使水稻倒伏、沖走，故危害大；水溫高，植株呼吸作用旺盛，體內積累的營養物質消耗快，故危害加重。