小麥稈黑粉病是一種真菌病害。病菌隨病株殘體在土壤、糞肥中越冬，也可以隨小麥種子做遠距離傳播。病菌侵染小麥幼芽，達到生長點以后就能隨著小麥的生長，為害小麥的整個植株，包括莖、葉和穗等。病株分蘗增多，發病初期可在葉片和葉鞘上發現與葉脈平行的條紋狀隆起，葉片不舒展。到小麥拔節至孕穗期癥狀逐漸明顯，植株明顯矮化和嚴重扭曲，隆起部分變黑，破裂，散出黑色孢子。多數病株不能抽穗并提前死亡。田間調查病情時注意不要太遲，最好在小麥孕穗期進行。

小麥稈黑粉病有兩個特點與防治有密切關系：一是病菌孢子能耐受不良環境，在干燥的土壤中能存活3~5年，這就要求小麥和玉米、豆類輪作，特別是針對重病田塊。如果改種水稻，一年就能根除。二是病菌只能侵染沒有出土的小麥幼芽，屬局部侵染、時間有限。因此，精細整地，適當淺播，適時下種等促進小麥快出苗、出齊苗的措施都有防病作用。藥劑防治的重點也是小麥幼芽和幼芽期。提倡使用無病種子和實行拌種或種子包衣。另外，不同小麥品種對稈黑粉病的抗性相差很大，可以選用抗病品種。上世紀五六十年代我國就依靠這些措施，基本控制了稈黑粉病的為害，而近年該病在一些地區嚴重發生主要是由于放松了防治工作，個別地區是種子帶菌所致。

早年藥劑防治使用70%五氯硝基苯粉劑按種子重量0.2%拌種，按種子重量的0.3%拌50%六氯代苯可濕性粉劑、70%敵克松粉劑、50%多菌靈可濕性粉劑、50%苯萊特可濕性粉劑、70%甲基托布津可濕性粉劑或按種子重量的0.15%拌種20%三唑酮、按種子重量的0.1%~0.13%拌種15%的三唑醇也有良好的防治效果。近年實驗證明每100公斤小麥拌2%立克秀（戊唑醇）濕拌劑200克或2.5%適樂時（咯菌清）懸浮種衣劑200毫升能夠獲得更好的防治效果。