白菜根腫病為真菌性病害，土壤能帶菌傳播，難以用藥防治，重病田應實行輪作。根腫病在酸性土壤上更容易發生，適當對土壤用石灰調整酸堿度，有利于減輕病害。

輕病田可以在播種前結合耕整地對病田土壤用硫酸銅消毒。發病初期用銅高尚27.12%堿式硫酸銅懸浮劑（澳大利亞紐發姆有限公司產品，購貨聯系電話：13851940748）、普力克722克/升霜霉威水劑（德國拜耳作物科學公司產品）等藥灌根。其中，堿式硫酸銅為保護性廣譜殺菌劑，對根腫病等真菌性病害和軟腐病等細菌性病害都有良好的預防作用，最好在病菌侵入作物前使用；霜霉威對根腫病、霜霉病等真菌性病害有較好的預防和治療作用，適宜在病害剛開始發生時使用。對重病田，最好趁高溫期，在蔬菜采收后灌水濕土，覆蓋塑料薄膜并密閉四周，使膜下土壤溫度達60℃左右后維持1周左右時間，這樣大概花10天左右時間，就能大量殺滅土壤中的病原微生物，大幅度減輕下茬菜病害的發生。