選肉厚、水分少、質地較硬、橙色較深、果面布有蠟粉的九成熟南瓜，于晴天用剪刀在留瓜柄3厘米長的瓜把處剪下，主蔓上第2個以后的瓜作貯藏用。貯藏的瓜不能遭霜凍。生長期間最好不使瓜直接著地，可在瓜下墊磚或吊空，并要防止陽光暴曬，采收時輕拿輕放。采收后宜在24-27℃下放置2周，使果皮硬化。貯藏適溫10℃左右，空氣相對濕度70-75%。

    一、堆藏：選擇陰涼、通風、干燥的倉庫，進行消毒。進倉時應嚴格檢查質量，剔除有病蟲害、有病疤和過嫩、倒瓤的瓜。在搬運、裝卸過程中必須輕搬、輕裝、輕運、輕卸，切勿拋滾碰撞。也可在倉庫內用木、竹或角鐵搭成分層貯藏架，鋪上草包，將瓜堆放在架上，或用板條箱墊一層麥稈和草當作貯藏容器。

    二、室內堆藏：地面要先鋪一層草包或麥稈，力求擺瓜平整。擺瓜的方式一般要和田間生長時期的狀態基本一致。擺放圓型南瓜時，將瓜蒂朝上平放，平行堆碼5層高為宜。擺放長型南瓜時，將瓜蒂朝里，瓜頂向外一個一個地依次堆碼成圓堆，每堆15-25個，高度以五六個瓜高為宜，并適當留出過道以便檢查。貯藏期間不宜翻動，及時剔除病斑瓜。貯藏前期，外界氣溫較高，晚上要打開窗戶通風換氣，白天關閉門窗，室內空氣要新鮮干燥，保持涼爽。外界氣溫較低時，特別是嚴寒的冬季，要關閉門窗防寒，保持0℃以上溫度。

    三、窖藏：入窖時將瓜堆放在鋪墊的細沙、麥稈或稻草上，堆瓜二三層。也可將瓜擺在菜架上。如果能使窖溫控制在7.2-10℃，可降低呼吸強度，減緩瓜內營養物質的損耗，延緩瓜的衰老過程，貯藏期可達3個月。