一、選擇適當的包裝材料：選擇防潮性、氣密性和堅固性良好的包裝材料。就目前來說，選擇聚乙烯為內包裝、厚紙箱為外包裝為佳。聚丙烯作包裝材料也可以，但不能使用聚氯乙烯，以防止氯離子滲入于香菇。

二、放置干燥劑：在密閉貯存的干香菇容器內，放入生石灰、無水氯化鈣或硅膠等干燥劑(經包裝處理)，可防止干香菇吸潮發霉，并阻止氧化反應的發生。

三、低溫避光貯藏：密封的干香菇應在15℃下避光貯藏，在1℃～5℃下貯藏效果更好，貯藏場所應避免陽光直射。為此，倉庫最好建在樓上，屋頂要有遮陰或降溫設備。

四、防止蟲害：為了降低害蟲，在包裝時要做好防蟲、防雜工作，不能將蟲卵和不衛生的雜物裝入袋內。干香菇進庫前，庫房應用磷化鋁進行密閉熏蒸消毒，待無藥味時再入庫。在貯藏過程中若發現害蟲，可將干香菇重新放到50℃～55℃環境中烘1～2小時，以殺死害蟲。也可用下列方法熏蒸處理：每立方米空間約用二硫化碳100克，熏蒸24小時；用氯化鈷17克，熏蒸24小時；用溴甲烷30克，熏蒸24～48小時；用磷化鋁1～4片(每片重3克)，熏蒸3～5天。熏蒸時要嚴格遵守有關規定和要求，以充分發揮藥物效果，并避免污染事故發生。