山楂品種間耐藏性不同，山東大金星、敞口、歪把子紅等耐貯藏，可貯藏到翌年的3月～4月份，而遼寧金星紅山楂只能貯藏一個月左右。用于貯藏的山楂應在果實充分成熟的前幾天采收，此時果皮完全轉紅，果點明顯，果面有果粉和蠟質，澀味基本消失。

    （1）傳統土法貯藏。較普遍的為埋藏法和溝藏法。埋藏：在背陰處挖直徑為67厘米、深1米的圓坑，坑底鋪16厘米厚的干凈河砂，將果實倒在砂上，鋪厚約34厘米為一層，上蓋4厘米厚的細砂，再放第二層果，厚度也為34厘米左右，上蓋8厘米厚細砂，以后隨著降溫加厚細砂覆蓋層，最后略高于地面。細砂要有一定的濕度，即手握成團但擠不出水為宜，此法可貯藏到翌年的4月～5月份。溝藏：又分為半地下溝貯藏和地下溝貯藏。均要求選干燥陰涼處挖深34厘米（半地下）或67厘米（地下）、寬67厘米的溝，長度不限。溝底及四周鋪上用石灰水或其它消毒液浸泡過又晾干的樹葉，將山楂果實輕倒上面，頂部堆成圓弧形，使弧尖高于地面，上鋪6厘米～10厘米厚的樹葉，再蓋草席或稻草。貯期要注意保濕和防熱（凍）,霜降后要逐步增加上面覆蓋物厚度，溝內溫度應保持在0℃～2℃，一般貯5個月～6個月。

    （2）簡易氣調貯藏。需要有溫度較合適的冷庫（窖）做保證。產地一般采用改良式通風庫或冷涼庫進行。用厚0.08毫米聚乙烯薄膜做成的硅窗袋，或用0.03毫米～0.05毫米厚聚乙烯薄膜制成普通袋，貯藏期保持果溫0℃～-2℃，袋內濕度90%左右，通過果實自發氣調保持袋內適宜氣體成分，當袋內氧氣低于2%,二氧化碳低于5%時，要開袋放氣，如果袋內放25:1（果重：高錳酸鉀載體）的乙烯吸收劑做保鮮劑，可進一步延長貯藏期，此法果實失水少、硬度大，營養成分損失少，加工及食用品質好，貯期可達6個月以上。

    （3）碳分子篩氣調貯藏。用厚約0.02毫米的高壓聚氯乙烯薄膜粘合成2.5×1.5×4米的塑料大帳。果實放入周轉箱或筐中入塑料大帳中，進行碳分子篩氣調貯藏。并利用調整開、關技術，把氣體成分控制在氧氣3%～5%,二氧化碳小于2%于0℃～0.5℃下貯藏，利用此法貯藏7個月，其好果率達95%以上。