黑木耳對膽結石、腎結石、膀胱結石等內源性異物有比較顯著的化解功能。黑木耳所含的發酵和植物堿，具有促進消化道與泌尿道各種腺體分泌的特性，并協同這些分泌物催化結石，滑潤管道，使結石排出。同時，黑木耳還含有多種礦物質，能對各種結石產生強烈的化學反應，剝脫、分化、侵蝕結石，使結石縮小，排出。對于初發結石，保持每天吃1-2次黑木耳，疼痛、惡嘔等癥狀可在2-4天內緩解，結石能在10天左右消失，對于較大較堅固的結石，其效果較差，但如長期食用黑木耳，亦可使有些人的結石逐漸變小變碎，排出體外。常吃黑木耳，還能預防血栓等癥的發生。

黑木耳對無意食下的難以消化的頭發、谷殼、木渣、沙子、金屬屑等異物也具有溶解與氧化作用。為防止和治療各種異物造成的胃腸不適或病癥，不妨常吃些黑木耳，尤其是從事理發、開礦、粉塵、鋸木、修理、護路等作業的人員更應經常吃些黑木耳。
黑木耳含有豐富的營養素，其脂肪成分中含有的卵磷脂、腦磷脂、鞘磷脂等磷脂類化合物，對于中老年人有特別的好處，可以幫助延緩老年人思維、記憶力減退及老年癡呆癥的發生，還能降低血漿中膽固醇、脂肪含量。

黑木耳中的腺苷具有降低血脂和血黏度，抑制血小板凝集以及減輕動脈硬化、防止血栓形成、防止中風發生的功能。

黑木耳中的碳水化合物成分中的甘露聚糖、木糖、戊糖等多元糖醇和膳食纖維，不會引起血糖和胰島素水平明顯波動。多元糖醇和膳食纖維都有預防便秘，改善腸內菌群平衡，預防腸癌的作用。

黑木耳含有一些生物堿，具有促進消化道、泌尿道腺體分泌的特點，故有化解腎結石、膽結石，促使排出的功效。

黑木耳中的鈣是一般肉類的30－40倍，是牛奶的2.3倍，所以是人體鈣的最好的來源，是預防骨質疏松的天然食品。

黑木耳含鐵量是菠菜的30倍，豬肝的4.3倍，大多數肉類的10倍，因此是缺鐵性貧血者最好的補鐵食品之一。

黑木耳（黑木耳粉）的食用方法：

黑木耳的食用方法很多，可以是涼拌黑木耳（或者與洋蔥涼拌黑木耳）、黑木耳炒肉、作為各種配菜、煮湯等等。黑木耳粉的食用更為方便，可以像飲料一樣沖服。

吃黑木耳貴在堅持，長期食用能夠通便，降低高血脂、高膽固醇、高血黏稠度，對高尿酸血癥也有好處。但是，具有出血傾向、消化不良、大便稀薄的人最好少吃或不吃。