在神經元細胞中, 軸突末端到細胞體的距離很長, 并且軸突末梢要釋放大量的神經遞質, 所以神經元必須不斷供給大量的物質, 包括蛋白質、膜, 以補充因軸突部位的胞吐而喪失的成分。由于核糖體只存在于神經細胞的細胞體和樹突中, 在軸突和軸突末梢沒有蛋白質的合成, 所以蛋白質和膜必須在細胞體中合成, 然后運輸到軸突, 這就是軸突運輸。
    軸突中以微管為基礎的運輸有兩種方式∶順向運輸和逆向運輸。