又稱座位。基因在染色體上所占的位置。在分子水平上，是有遺傳效應的DNA序列。一個基因座可以是一個基因，一個基因的一部分，或具有某種調控作用的DNA序列。基因座與位點（site）不同，后者是一個順反子內部的突變位置，可以小到一個核苷酸對。