小鼠對環(huán)境的適應性的自體調節(jié)能力和疾病抗御能力較其他實驗動物差，而小鼠的品種和品系繁多，各個品種和品系都有自己的特殊要求，因此必須根據實際情況給予一個清潔舒適的生活環(huán)境。不同等級的小鼠應生活在相應的設施中。
小鼠臨界溫度為低溫10℃，高溫37℃，溫度中性范圍30～33℃。飼養(yǎng)環(huán)境控制應達到如下要求：溫度18～29℃；相對濕度40～70％；最好控制在18～22℃,濕度50～60％。一般小鼠飼養(yǎng)盒內溫度比環(huán)境高1～2℃，濕度高5～10％。
要保持溫度、濕度相對穩(wěn)定，日溫差不超過3℃,否則會直接影響小鼠的生長發(fā)育、生產繁殖、甚至導致小鼠發(fā)生疾病，從而影響實驗結果。溫濕度的相對穩(wěn)定對于建筑條件較差的地方可用空氣調節(jié)器、加濕器、在北方用暖氣進行調節(jié)。為了保持室內空氣新鮮，氨濃度不超過20ppm，換氣次數應達到10～20次／小時。
現在我國普遍采用無毒塑料鼠盒，不銹鋼絲籠蓋，金屬籠架。籠架一般可移動，并可經受多種方法消毒滅菌。用清潔層流架小環(huán)境控制飼養(yǎng)二、三級小鼠不失為一種較好的方法。籠盒既要保證小鼠有活動的空間，又要阻止其啃咬磨牙咬破鼠盒逃逸，便于清洗消毒。帶濾帽的籠具可減少微生物生物污染，但籠內氨氣和其它有害氣體濃度較高。有時影響實驗結果的準確性。飲水器可使用玻璃瓶、塑料瓶，瓶塞上裝有金屬或玻璃飲水管，容量一般為250ml或500ml。
墊料是小鼠生活環(huán)境中直接接觸的鋪墊物，起吸濕（尿）、保暖、做窩的作用。因此墊料應有強吸濕性、無毒、無刺激氣味、無粉塵、不可食，并使動物感到舒適。墊料必需經消毒滅菌處理，除去潛在的病原體和有害物質。一般墊料以闊葉林木的刨花或鋸末為宜，也可用玉米芯加工粉碎除塵后使用。
在實驗中切忌用針葉木（松、檜、杉）刨花做墊料，這類刨花發(fā)出具有芳香味的揮發(fā)性物質，可對肝細胞產生損害，使藥理和毒理方面的實驗受到極大干擾。
國外有專門的墊料生產企業(yè)，進行墊料的生產，而我國的墊料產業(yè)尚需開發(fā)。目前我國實驗動物部門大部分采用木材加工副產品如鋸末、刨花等，其來源、樹木種類很難控制，給實驗動物質量控制帶來很多不利影響。