根據《加強食品質量安全監督管理工作實施意見》的有關規定，食品加工工藝流程設置應當科學、合理。生產加工過程應當嚴格、規范，采取必要的措施防止生食品與熟食品、原料與半成品的交叉污染。
    加工工藝和生產過程是影響食品質量安全的重要環節，工藝流程控制不當會對食品質量安全造成重大影響。如，2001年吉林市發生的學生豆奶中毒事件，就是因為生產企業擅自改變工藝參數，將殺菌溫度由82ºC降低到60ºC，不僅不能起到滅菌的作用，反而促進細菌生長，直接造成微生物指標超標，致使大批學生中毒。