注水法 可用市場上現成的注水器，也可自制。自制的方法是把農用噴霧器的噴頭鋸掉，噴桿頂端制成尖狀，在噴桿頭部30厘米以內打幾個出水孔，即制成一個食用菌補水器。這樣把噴桿插到菌棒內就可流水了。

浸水法 在出菇棚附近挖一地溝或用水泥抹一水池，然后把菌棒堆放于池內，表面壓上石頭等重物防止菌袋浮出水面，然后放水使菌袋全部浸在水中，注意及時加水，保持原來水位，這樣浸水8~24小時使菌袋含水量達到70%。

砌墻補水法 把菌棒的塑料袋撕去1/3，然后將有塑料袋的一頭向外，兩架并一架同砌，中間相隔15厘米。注意不要太近，以免溫度升高燒菌。中間放比較硬一點的營養土，層與層之間抹軟一點的營養泥，高度砌12層以下，以免倒垛。上砌水池。出一潮菇后補水。

脫袋補水法 將塑料袋全部剝去，豎排成臥排于1～1.2米寬的陽畦內，排列要緊湊，填入營養土，料面覆土厚1～2厘米，往陽畦內灌大水，使培養料吸足水，按常規方法管理。