良好的自然通風(fēng)，必要時應(yīng)配備抽風(fēng)機(jī)。接種、分離及鑒定細(xì)菌等操作應(yīng)在生物安全柜中進(jìn)行，對結(jié)核桿菌等傳染性極強(qiáng)的微生物學(xué)檢驗(yàn)時必須在100％外臨床微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室接觸多種有害微生物，為了防止交叉污染，保護(hù)工作人員健康，實(shí)驗(yàn)室應(yīng)至少劃分成3個區(qū)。

包括辦公室、休息室、培養(yǎng)基配制室與試劑儲藏室。此區(qū)域禁止帶人細(xì)菌檢驗(yàn)標(biāo)本。

（1）整潔：微生物操作區(qū)是各種病原菌相對集中的地方，為了減少粉塵流動，防止交叉污染，操作區(qū)應(yīng)與外界分開。實(shí)驗(yàn)室工作人員進(jìn)入操作區(qū)應(yīng)換鞋，送標(biāo)本人員不進(jìn)入操作區(qū)，操作區(qū)地面用專用拖把每天拖1 次，每周用消毒劑擦洗1 次。每天早上工作前，用紫外線照射30min，或每天工作后，用紫外線照射60min，對整個操作區(qū)進(jìn)行消毒；下午工作結(jié)束后用消毒液消毒工作臺面，以保證工作環(huán)境的安全清潔。
（2）光線：細(xì)菌培養(yǎng)的細(xì)小菌落及血清試驗(yàn)?zāi)�集顆粒的觀察， 都需要有充足的光線。操作區(qū)除設(shè)置常規(guī)照明燈外，還必須安裝操作臺燈，以保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的正確判斷。
（3） 通風(fēng)：由于各種病原菌集中，空氣污濁，實(shí)驗(yàn)室要求在保持排風(fēng)的生物安全柜中進(jìn)行。
（4）溫度和濕度：由于無菌操作的要求，實(shí)驗(yàn)過程中經(jīng)常使用酒精燈，因此，微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室不能安裝吊扇。為了達(dá)到實(shí)驗(yàn)所需的適宜溫度，尤其是滿足某些儀器對溫度濕度的要求，實(shí)驗(yàn)室應(yīng)安裝空調(diào)。
（5）電源：要求提供穩(wěn)壓、恒頻的電源；根據(jù)儀器設(shè)備要求，必要時配備不間斷電源。
（6）水源：操作區(qū)內(nèi)須設(shè)置水源。用于標(biāo)本處理（如細(xì)菌染色） 的水槽與工作人員洗手用的水槽不能混用。
（7）污染物處理：操作區(qū)須備有消毒缸，以處理沾有活菌的玻片等污染物品。檢驗(yàn)剩余的標(biāo)本及使用過的帶菌平板、試管均須集中地點(diǎn)安全放置，經(jīng)消毒滅菌處理后再洗滌或丟棄。

（1）無菌室應(yīng)完全封閉，進(jìn)出無菌室至少要經(jīng)兩道門，中間隔有緩沖間，無菌室與外間設(shè)置一個可開閉的窗口，用于傳遞器具。
（2）無菌室必須保持整潔。工作人員進(jìn)入無菌室應(yīng)換專用鞋、專用衣。無菌室使用前須用紫外線消毒30min ，操作結(jié)束后清潔臺面，再用紫外線消毒30min 。定期用乳酸或甲醛熏蒸，徹底消毒。
（3）無菌室僅用于培養(yǎng)基分裝等無菌操作，不能進(jìn)行有菌標(biāo)本的操作。操作人員操作時應(yīng)嚴(yán)格關(guān)門，并戴好專用的口罩、帽子。