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固定相的選擇
基本選擇原則：
² 相似相容原理，用非極性固定相分析非極性化合物（反之，極性）
² 如果化合物可用極性不同的固定相分析，首選極性小的
² 對于偶極或氫鍵化合物，選擇含氰基或聚乙二醇（WAX）的固定相
² 輕烴或永久氣體，選擇PLOT柱
² 盡可能避免選擇污染或干擾檢測器的固定相：如腈基對于NPD，含氟固定相對于ECD
² 對于特殊應用，根據可提供的專用柱選擇
常用固定相介紹
SE-30（OV-1，OV-101）
組成：100%聚甲基硅氧烷，非極性
類似品牌：CP-Sil 5CB、 AC-1、 DB-1、 HP-1、 SPB-1、 007-1、 Rtx-1、 BP-1…
主要應用：烴類、胺類、酚類、農藥、PCBs、揮發油硫化物等
SE-54（SE-52）
組成：5%苯基，95%聚甲基硅氧烷，弱極性
類似品牌：CP-Sil 8CB、 AC-5、 DB-5、 HP-5、 SPB-5、 Rtx-5、 BP-5…
主要應用：藥物、芳香烴、酚、酯、生物堿、鹵代烴
OV-1701
組成：7%氰甲基，7%苯基聚甲基硅氧烷，中等極性
類似品牌：CP-Sil 19CB、 AC-10、 DB-1701、 HP-1701、 SPB-1701、 BP-10、 Rtx-1701…
主要應用：藥物、農藥、除草劑、TMS糖、PCB等
OV-17
組成：50%苯基聚甲基硅氧烷，中等極性
類似品牌：CP-Sil 24CB、 DB-17、 HP-50、 SPB-50、 SP2250、 Rtx-50…
主要應用：藥物、農藥、甾類、PAH、甘油三酸酯等
PEG-20M
組成：聚乙二醇20M，強極性
類似品牌CP-WAX 52CB、 DB-WAX、 HP-Wax、 Carbowax 、 SUPELCOWAX 10
主要應用：醇類、酯類、醛類、溶劑、單芳、精油等
FFAP
組成：聚乙二醇20M對苯二甲酸的反應產物，強極性
類似品牌：CP-WAX 58CB、 DB-FFAP、 HP-FFAP、 SP-1000
主要應用：醇類、酸類、酯類、醛類、腈類等
OV-225
組成：25%氰丙基、25%苯基聚甲基硅氧烷，中等極性，強于OV-17和OV-1701
類似品牌：CP-SIL 43CB、 DB-225、 SP-2330、 SPB-225
主要應用：脂肪酸甲酯、PUFA、Alditol、TMS衍生的糖類等
OV-210
組成：50%三氟丙基聚甲基硅氧烷，高極性
類似品牌：DB-210、Rtx200…
主要應用：極性化合物、有機氯化物
柱長度的選擇
分辨率與柱長的平方根成正比。在其他條件不變的情況下，為取得加倍的分辨率需要４倍的柱長。較短的柱子適于較簡單的樣品，尤其是由那些在結構，極性和揮發性上相差較大組分組成的樣品。
Ø 15m的短柱用于快速分離較簡單的樣品，也適于掃描分析；
Ø 25m-30m是常用的柱長，大多數的分析在此長度的柱子上完成；
Ø 50m、60m或 更長的柱子用于分離比較復雜的樣品。
（應注意，柱長增加分析時間也增加）
柱內徑的選擇
柱徑直接影響柱子的效率、保留特性和樣品容量。小口徑柱比大口徑柱有更高的柱效，但柱容量更小。
0.15-0.18mm：更適合GC-MS以及需要很高柱效的應用
0.25mm：具有較高的柱效，但柱容量較低。分離復雜樣品較好。
0.32mm：柱效稍低于0.25的色譜柱，但柱容量約高60%。
0.53mm: 具有類似于填充柱的柱容量，可用于分流進樣，也可用于不分流進樣，當柱容量是主要考慮因素時（如痕量分析），選擇大口徑毛細管柱較為合適。
液膜厚度的選擇
液膜厚度影響柱子的保留特性和柱容量。厚度增加，保留也增加。
0.1-0.2um：薄液膜的毛細管柱比厚液膜的柱洗脫組分快，所需要柱溫度低，且高溫下柱流失較小，適用高沸點樣品的分析。
0.25-0.5um: 常用的液膜厚度。
0.8-1.5um：厚液膜，對于分析低沸點的化合物較為有利。
3.0-5.0um：超厚液膜，用于分析氣體、溶劑殘留、吹掃物等
（液膜越厚，則最高使用溫度越低，因為有更大的柱流失。）
