禽流感的病原體是甲型流感病毒的H5N1亞型病毒。1997年香港的禽流感與目前亞洲10個國家和地區發生的禽流感，病原體都相同。H5N1型禽流感病毒是人與動物共患的流感病原體，容易引起世界性大流行。由于病毒多變異，導致甲型流感反復發生，難以徹底根除。