一、漚根
漚根非病理性病害，而是一種生理性災害。幾乎所有蔬菜幼苗均可受其害，瓜類早春苗床發生較重，尤以育苗技術粗放、氣候不良的地方極易發生。
1．癥狀。發生漚根的幼苗，長時間不發新根，不定根少或完全沒有，原有根皮發黃呈銹褐色，逐漸腐爛。漚根初期，幼苗葉片變薄，陽光照射后白天萎蔫，葉緣焦枯，逐漸整株枯死，病苗極易從土中拔起。
2．發生條件。漚根多發生在幼苗發育前期，陜西關中地區多在2--3月份，北方多在3--4月份發生。辣椒苗漚根的主要原因是苗床土壤濕度過高，或遇連陰雨雪天氣，床溫長時間低于12℃，光照不足，土壤過濕缺氧，妨礙根系正常發育，甚至超越根系耐受限度，使根系逐漸變褐死亡。
3．防治方法。防治漚根應從育苗管理抓起，宜選地勢高、排水良好、背風向陽的地段作苗床地，床土需增施有機肥兼配磷鉀肥。出苗后注意天氣變化，做好通風換氣，可撒干細土或草木灰降低床內濕度，同時認真做好保溫，可用雙層塑料薄膜覆蓋，夜間可加蓋草簾。條件許可，可采用地熱線、營養盤、營養缽、營養方等方式培育壯苗。
二、燒根
燒根系栽培技術不良而人為造成的生理性病害。
1．發生條件。燒根現象多發生在幼苗出土期和幼苗出土后的一段時間，多與床土肥料種類、性質、多少緊密相連，有時也與床土水分和播后覆土厚度有關。如苗床培養土中施肥過多，肥料濃度高則易產生生理干旱性燒根；若施入未腐熟有機肥，經灌水和覆膜，土溫驟增，促使有機肥發酵，產生大量熱量，使根際土溫劇增，也易導致燒根；若施肥不勻，灌水不均以及畦面凸凹不平亦會出現局部燒根；若播后覆土太薄，種子發芽生根后床溫高，表土干燥，也易形成燒根或燒芽。
2．預防方法。苗床應施用充分腐熟的有機肥，氮肥使用不得過量，灰肥應適當少施。肥料施入床內后要同床土摻和均勻，整平畦面，使床土虛實一致，并灌足底水。播后覆土要適宜，消除土壤燒根因素。出苗后宜選擇晴天中午及時澆清水，稀釋土壤溶液，隨后覆蓋細土，封閉苗床，中午注意苗床遮陰，促使增生新根。
三、燒苗
燒苗是一種高溫生理災害，燒苗現象發生快、受害重，幾小時之內可造成整床幼苗驟然死亡，損失慘重。
1．癥狀。燒苗之初，幼葉出現萎蔫，幼苗變軟、彎曲，進而整株葉片萎蔫，幼莖下垂，隨高溫時間延長，根系受害，整株死亡。
2．發生條件。多發生在氣溫多變的育苗管理中期，因前期氣溫低，后期白天全揭膜，一般不易發生燒苗。高溫是發生燒苗的主要條件，尤其是幼苗生長的中期，晴天中午若不及時揭膜，實施通風降溫，溫度會迅速上升，當床溫高達40℃以上時，容易產生燒苗現象。燒苗還與苗床濕度有關。苗床濕度大燒苗輕，濕度小燒苗則重。
3．預防措施。經常注意天氣預報，晴天要適時適量做好苗床通風管理，使床溫白天保持在20--25℃。若剛發生燒苗，宜及時進行苗床遮陰，待高溫過后床溫降至適溫可逐漸通風。并可適量從苗床一端閉膜澆水，夜間揭除遮蔭物，次日再行正常通風。
四、閃苗
閃苗也是因苗床管理不善，尤其是通風不良造成幼苗生長環境突變而引起的一種生理失衡的病變，它發生于整個幼苗覆蓋生長期，尤以缺乏育苗經驗與技術之人最易發生此種現象。
1．癥狀。揭膜之后，幼苗很快發生萎蔫現象，繼而葉緣上卷，葉片局部或全部變白干枯，但莖部尚好，嚴重時也會造成幼苗整株干枯死亡。因其“閃苗”現象是在揭膜后不久即發生的，好似—閃即傷—樣，所以叫“閃苗”。
2．發生原因。當苗床內外溫差較大，且床溫超過30℃以上時，猛然大量通風，空氣流動加速，引起葉片蒸發量劇增，失水過多，形成生理性干枯。同時因冷風入床內，幼苗在較高的溫度下驟遇冷流，也會很快產生葉片萎蔫現象，進而干枯，亦稱冷風閃苗或“冷閃”。
3．預防措施。注意及時通風，當床溫上升到20℃時，要適時正確掌握通風量，一般隨氣溫升高通風量由小漸大，通風口由少增多。通風量的大小應使苗床溫度保持在幼苗生長適宜范圍以內為準。并要準確選擇通風口的方位，應使通風口在背風一面。
五、僵苗
僵苗又叫小老苗，是苗床土壤管理不良和苗床結構不合理造成的一種生理障害。
1．癥狀。幼苗生長發育遲緩，苗株瘦弱，葉片黃小，莖桿細硬，并顯紫色，雖然苗齡不大，但看似如同老苗一樣，故稱“小老苗”。
2．發生原因。苗床土壤施肥不足，肥力低下(尤其缺乏氮肥)、土壤干旱以及土壤質地粘重等不良栽培因素是形成僵苗的主要因素。另則透氣性好，但保水保肥很差的土壤，如沙壤土育苗，更易形成小老苗。若育苗床上的拱棚低矮，也易形成小老苗。
3．防治方法。宜選擇保水保肥力好的壤土作為育苗場地。配制床土時，既要施足腐熟的有機肥料，也要施足幼苗發育所需的氮磷鉀營養，尤其是氮素肥料尤為重要。并要灌足澆透底墑水，適時巧澆苗期水，使床內水分(土壤持水量)保持70％--80％左右。
六、徒長苗
徒長是苗期常見的生長發育失常現象。徒長苗缺乏抗御自然災害的能力，極易遭受病菌侵染，同時延緩發育，使花芽分化及開花期后延，容易造成落蕾、落花及落果。定植大田后緩苗差，最終導致減產。
1．癥狀。幼苗莖稈細高、節間拉長、莖色黃綠、葉片質地松軟、葉身變薄、色澤黃綠、根系細弱。
2．發生成因。晴天苗床通風不及時、床溫偏高、濕度過大、播種密度和定苗密度過大、氮肥施用過量，是形成徒長苗的主要因素。此外陰雨天過多、光照不足也是原因之一。
3．防治方法。依據幼苗各生育階段特點及其溫度因子，及時做好通風工作，尤以晴天中午更應注意。苗床濕度過大時，除加強通風排濕外，可在育苗初期向床內撒細干土；依苗齡變化，適時做好間苗定苗，以避免相互擁擠；光照不足時宜延長揭膜見光時間。如有徒長現象，可用200mg／kg矮壯素進行葉面噴霧，苗期噴施2次，可控制徒長，增加莖粗，并促根系發育。矮壯素噴霧宜早晚間進行，處理后可適當通風，禁止噴后1--2d內向苗床澆水。