利用NCBI可以查詢不同物種間相對應的基因，如與小鼠相近的人類的基因：

人和大鼠是做過全基因組比較基因組學研究的，UCSC做得最全全面，已有相關的paper發表。在UCSC的Genome Browser中，可以通過基因名查詢人、小鼠、大鼠、雞、猩猩、狗、斑馬魚、河豚這些物種之間的對應或相似的基因。

也可以通過homologene 來進行查詢：
例題:找到跟人的p21基因相對應的大鼠基因.
1. 進入entrez gene.

2.search gene for p21
To limit your search to a specific field, select:gene name
Limit by Taxonomy: Mammalia: Homo sapiens

3.選擇第一個 CDKN1A,在link中新窗口打開homologene
得到：R.norvegicus--- Cdkn1a--- cyclin-dependent kinase inhibitor 1A

4.在大鼠芯片list中查找Cdkn1a,
得:13 17 n0313f03 U33314 Rn.10128
Rattus norvegicus serine/threonine kinase beta-PAK mRNA, complete cds p21 (CDKN1A)-activated kinase 3 Pak3

就這樣找到了和人的p21基因對應的大鼠基因Cdkn1a. 如果你對該序列還不是很放心的話，可以將兩條序列進行比對，或者尋找原始文獻確證一下。