在RNA凝膠電泳之前，先用乙二醛等變性劑處理RNA，再在適宜條件下電泳使充分變性的RNA直接吸印到硝酸纖維膜上。固定后除去變性劑，然后進行雜交。
試劑：
乙二醛：4mol/L（約為30%），經過陰陽離子交換樹脂純化，使pH為5.5～6.0
磷酸緩沖液：80mmol/L pH6.5～7.0 磷酸緩沖液：10mmol/L pH6.5～7.0
Tris-HCl:20mmol/L pH7.8 二甲基亞砜：分析純 20×SSC：0.3mol/L檸檬酸鈉，3mol/L NaCl

基本步驟
1.RNA變性　　
吸取1μl 80mmol/L磷酸緩沖液，1μl RNA樣品（最多100μg），2μl，4mol/L 乙二醇，4μl二甲基亞砜。混勻后，50℃水浴1h，然后放入冰中。
2．電泳 變性結束后，加入含有50%甘油的10mmol/L磷酸緩沖液2μl和少量溴酚藍，混勻后點樣于1.0%的凝膠上，以4～5V/cm電壓電泳。凝膠電泳液為10mmol/L磷酸緩沖液， pH6.5～7.0。
3．轉移
變性處理后的RNA可以轉移并結合到硝酸纖維膜上，轉移過程和轉移變性與DNA相同。
4．固定
用20×SSC轉移RNA。膜夾在兩層干凈濾紙中晾干，80℃烤膜2h。
RNA膜固定后，放入20mmol/L Tris-HCl中，100℃處理5～10min，去除乙二醛，然后進行雜交。