1.雙歧桿菌
人體內有益菌群主要有乳酸菌和雙歧桿菌。雙歧桿菌對促進人體的發育、維持和提高免疫力、延緩機體衰老等方面起著重要的作用。近百年的研究證明雙歧桿菌是人類腸道內的優勢菌群。人體在成長過程中，由于疾病、衰老等原因，體內雙歧桿菌在數量上和總菌占有率上均逐漸下降。因此，有人將體內雙歧桿菌的數量作為健康的標志之一。新生兒腸道中雙歧桿菌占細菌總數的92%，其隨年齡增長而減少，至老年臨終前完全消失。雙歧桿菌在生長發育過程中隨時被消耗，又隨時增長達到一定的平衡；但當人進入中老年，其自我調節能力減弱，適當地進行外源性補充，對保持和促進機體健康具有積極的意義。目前含有雙歧桿菌的保健食品已有多種，也有它的優勢，但生產成本相比之下偏高及活菌的保存有一定的難度。目前市場上流行一種在食品或飲料中添加可以促進雙歧桿菌生長的低聚糖，食入后能刺激腸道內原有的雙歧桿菌生長繁殖，達到同樣的目的。
2.乳酸菌
凡可使糖類發酵產生乳酸的細菌，都稱乳酸菌，包括乳桿菌、嗜乳鏈球菌、酵母等。它們和雙歧桿菌一起控制著人體生態菌群的平衡，不斷清除有毒物質，抵御外來致病菌的入侵。對常見致病菌(如痢疾桿菌、傷寒桿菌、致病性大腸桿菌、葡萄球菌等)有拮抗作用。尤其對老人和嬰兒，可抑制病原菌和腐敗菌的生長，防止便秘、下痢和胃腸障礙等。它們吐出大量的乳酸，促使腸壁蠕動、幫助消化、排盡糞渣，殺滅病原菌，在腸道內合成維生素、氨基酸和提高人體對鈣、磷、鐵離子等營養素的吸收。因為乳酸菌群具有抗感染、除毒素、協助營養攝取的獨特功能，所以能有效地調節腸道微生態平衡。能消除致病原，大大地減少亞硝胺類和腐敗細菌毒素對癌的誘發性，同時可激活免疫反應，增強人體免疫力。乳酸菌分解乳糖，產生半乳糖，所以有助于兒童腦及神經系統的發育。在國內外市場上乳酸菌飲料、酸奶、泡菜、酸菜、醬、醬油以及口服液等乳酸菌及其制品巳被公認是一類比較好的保健食品。
