在實際當中，有不少的失眠是由于患了某種疾病以后而發生的。因此說失眠有時是其他疾病的伴發癥狀，如果原發疾病減輕或治愈了，則失眠也隨之減輕與消失。可伴發失眠的病種很多，如果按系統分，主要的有以下這些：
(1)中樞神經系統疾病：主要有腦外傷、腦腫瘤、松果體瘤、腦梗塞、帕金森氏病、老年性癡呆、癲癇等，這些疾病都可伴有失眠出現。
(2)循環系統疾病：主要有高血壓病、冠心病、動靜脈炎等。其中心功能衰竭者常伴有嚴重的睡眠障礙。
(3)消化系統疾病：主要有潰瘍病、腸炎、痢疾等，尤其是這些疾病造成的腹痛、燒心、惡心、嘔吐、腹瀉等癥狀，均能嚴重影響正常睡眠。
(4)泌尿系統疾病：泌尿系統的急性病證，如膀胱炎、腎盂腎炎引起的尿頻、尿急、尿痛，可嚴重干擾睡眠。慢性腎功能衰竭時的睡眠，常常是短而破碎，一般只有腎透析或腎移植才能有效地解決問題。
(5)呼吸系統疾病：急、慢性支氣管炎、肺氣腫、百日咳、肺心病等，均可嚴重干擾正常的睡眠。
(6)變態反應性疾病：這類疾病如皮膚瘙癢、鼻阻塞、蕁麻疹等也常干擾睡眠。
除以上舉出的諸系統的病證外，其他如骨骼、肌肉、關節的炎癥和疼痛、腫瘤引起的憂慮、疼痛等也常嚴重影響正常的睡眠，不一一贅舉。總之，各系統的疾病，無論是疾病本身的痛苦，還是由疾病引起的心理障礙，均可干擾睡眠。