防治蘋果樹腐爛病，必須加強栽培管理，增強樹體抗病能力；及時刮治病斑，進行藥劑防治；搞好清園，減少病源。只有四季綜合措施，才能收到良好效果。

春季：果樹發芽前，對精細刮治過的腐爛病斑和兩三年生枝未愈合剪口、枝杈處，涂清園專用型殺菌劑（如康健等），藥干后再涂愈合劑或封剪油等。這樣既能防止病發，又能促使傷口早愈。然后全樹噴灑殺菌劑（如康健等），著重噴3米以上大枝。春防是防治腐爛病很關鍵的一次。

夏季 ：發病較重或與重病園相鄰的果園，用和春季噴涂相同的藥液涂刷主枝、主干和大枝中下部（特別是枝杈、傷口處）1至2次。

秋季 ：對全園逐株檢查各大枝隱藏部位、傷口、枝杈處，發現病爛立即刮治或剪除，刮治過的傷口涂殺菌劑1至2次，然后涂愈合劑保護。

冬季：結合冬剪，搞好清園工作，清除死樹、枯枝，挖除干樁枯橛，刮除枝干老翹皮和病皮。將病枝、病皮集中清出果園，及時燒掉，以降低病菌密度。全樹噴1次殺菌劑（如康健等）。對剪口應先涂1次藥液，晾干后再用愈合劑保護。

為了防止人為造成的病菌傳播，要求專剪專用，一園至少兩把剪刀，剪過病枝的剪刀不剪好枝，并立即消毒，做到剪、鋸等工具用一次消毒一次。病樹在刮治、藥治的同時，要加強肥水管理，增施有機肥，少用氮肥，以增加樹體抗病能力。