對蘑菇而言，除要求培養的菌類以外的微生物都統稱為雜菌，在蘑菇生長過程中一旦感染雜菌，雜菌就會迅速繁殖，與蘑菇爭奪養料和空間，甚至分泌毒素或寄生在蘑菇上，影響蘑菇的正常生長發育，從而給生產造成經濟損失。因此，在蘑菇的制種和栽培中，應保證菌種優良純正無雜，并且在接種過程要樹立嚴格的無菌觀念，掌握和運用消毒、滅菌技術，嚴防雜菌污染，以此降低微生物對蘑菇的正常生長發育的影響。

　　據專業從事食品殺菌技術研發和設備制造的上海康久消毒技術有限公司經理毛杉女士認為：由于蘑菇種類的不同，對培養基質、工具、環境中的無菌程度要求也不同。因此，可以根據生產情況選用不同的方法，如滅菌、消毒、防腐。

　　滅菌是指在一定范圍內用物理或化學的方法，徹底殺滅物料、容器、用具和空氣中的一切微生物，包括微生物的營養體和休眠體，使物料成為無菌狀態。消毒是采用物理或化學的方法，殺滅或清除基質中、物體表面及環境中的部分微生物。除菌是一種機械方法（如過濾、離心分離、NICOLER動態殺菌技術等），除去液體或氣體中微生物的方法。防腐是用來防止或抑制微生物生長繁殖的技術，是一個抑菌過程。殺菌泛指殺死微生物菌體，通常不包括芽孢，有這種作用的藥劑稱為殺菌劑。

　　毛杉女士繼續說道：消毒滅菌是排除雜菌干擾，為蘑菇創造潔凈生長環境的重要保證，也是蘑菇生產中的一項基本技術，是蘑菇生產成敗的關鍵環節，其分別為：

　　一、無菌操作環節

　　1、接種室應保持清潔，用煤粉酚皂液擦洗臺面及墻壁，定期用乳酸或甲醛熏蒸。每次使用前，均應用紫外燈滅菌；使用過程中，采用“NICOLER”動態殺菌機，此機器在工人上班時開機、過程中持續殺菌不允許關機，工人下班后同步關機，對人體無害處的同時，時時在線滅殺空氣中的霉菌、枯草桿菌、沙門氏菌等雜菌。

　　2、進入接種室前，應先做好個人衛生工作，在緩沖間內要更換工作鞋帽、工作衣、戴口罩。工作衣、工作鞋、口罩只準在接種室內使用。不準穿到其它地方去，并要定期更換、消毒。

　　3、接種的試管、三角并瓶等應做好標記，注明培養基、菌種的名稱、日期。移入接種室內的所有物品，均須在緩沖室用70%酒精擦試干凈。

　　4、接種前，雙手采用自動感應手消毒器手部消毒，建議采用75%醫用酒精作為消毒介質流程為：“感應給皂機洗手—水龍頭沖洗—感應式烘干—感應式手消毒”；以首次殺菌后時間計算，以后每隔60-90分鐘對手部重新消毒一次，阻隔手部細菌的滋生及繁衍。

　　5、培養箱及接種工具應經常清潔消毒；操作過程不離開酒精燈火焰；棉塞不亂放；接種工具使用前后均需火焰滅菌。

　　二、 接種室的空氣消毒方法

　　1、紫外線消毒法，其殺菌機理是當其作用于生物體時，可導致細胞內核酸和酶發生光化學反應，而使細胞死亡。另外，紫外線還可使空氣中的氧氣產生臭氧，臭氧具有殺菌作用。

　　但對真菌效果差，只起輔助消毒作用，還需配合藥物使用。由于紫外線對人體有傷害作用，不要在開啟紫外燈的情況下工作。

　　2、臭氧發生器，能高效、快速殺滅空氣中和物體表面各種微生物，接種成功率可達97％以上；同時具有性能穩定、操作簡單、耗電小的特點。對人體有傷害作用，不要在有人的情況下工作。

　　3、“NICOLER動態空氣消毒機”，對車間內的空氣進行消毒，保證食品安全。該消毒技術對車間消毒時，人可同時在車間內工作，對人體沒有任何危害，同時使受控環境保持在“無菌無塵”標準。

　　4、甲醛和高錳酸鉀熏蒸法，使用方法是每立方米空間用8～10mL 40%甲醛和5～7g高錳酸鉀，先將高錳酸鉀倒入陶瓷或玻璃容器內，再加入甲醛；加入甲醛后人立即離開，密閉房間消毒時20～30分鐘。

　　三、接種室無菌程度檢查方法

　　取無菌的營養瓊脂平板，在接種室內臺上和臺下各放一套，把皿蓋打開15min，然后蓋好，倒置37℃恒溫培養24-28小時，如果每個皿內菌落不超過4個，則可以認為無菌程度良好，若菌落很多，則應對接種室進一步滅菌。