大棚蔬菜苗期漚根是一種生理性病害，大多由于管理不當所引起。初發時根部出現銹斑，嚴重時根部腐爛，不長新根，幼苗變黃萎蔫，后期全部死亡。

保持適當溫度 床土配制要合理，播后至苗期應保證足夠的土溫。如遇陰雨天，光照不足時，應采取增溫保溫措施。早春育苗最好在棚(室)內采用電熱溫床進行育苗，以利于保溫。

及時降低濕度 在大棚或溫室等保護地育苗時，一般苗床不明顯干旱(表土手握不散團)時不澆水，應盡量少澆水或不澆水；明顯干旱時澆水量也不宜過大。苗床內做到寧干勿濕，如果苗床過干，可覆蓋濕潤細土，這樣既可緩解幼苗對水分的需求，又能降低苗床內的空氣濕度，床內濕度過大，可覆蓋干草木灰，也可在氣溫較高的中午適當進行通風排濕。

注意增加光照 育苗前，要選擇光照充足的地方建苗床。這樣有利于幼苗健壯生長發育，增強其抗病能力，減輕蔬菜苗期漚根的發生或蔓延。

施足農家肥 蔬菜育苗，要增施農家肥，尤其是熱性肥，既可培肥地力，培育壯苗，提高蔬菜幼苗抗病能力，又可提高地溫，減輕病害發生，具體做法是：在蔬菜育苗前，將充分腐熟的熱性農家肥搗碎與床土混拌。但必須用腐熟的熱性農家肥，否則會造成燒根。

適時通風 在子葉展開后，選擇晴暖天氣揭開覆蓋物通風，并向苗床內均勻撒施一層細干土，隨后蓋嚴覆蓋物，這樣既可降低床土濕度，又有一定的增溫作用。