1.要經常打撈食場的殘渣剩餌，并每隔5天用100~150克漂白粉或2.5~5公斤生石灰加水溶化后，均勻潑灑于食場水面（未溶于水的漂白粉或生石灰顆粒都不要投入，以免草、鯉魚當作餌料攝食后致死）。

2.長期用藥物掛袋（簍），每袋中裝漂白粉100~150克或生石灰1.5~2.5公斤，20天左右換藥1次，每天每個食場掛袋（簍）2~3個。

池水消毒

每間隔半月左右，按每畝水面水深1米，用生石灰20~25公斤或漂白粉0.6公斤溶水全池潑灑。池水長期浸泡苦楝樹枝葉或樟樹枝葉，也可預防草魚出血、爛鰓、腸炎病的發生，每畝水面浸泡25~40公斤。

草料消毒

飼喂魚草料時，除要求鮮嫩、干凈外，最好在飼喂前用2%的食鹽水或在1立方米水中放5~10克漂白粉溶液浸泡10~20分鐘后，再投料讓魚攝食。

內服消毒

飼喂魚精料時，除無霉無毒外，還可制藥餌讓魚服食。方法是每100公斤草魚，每10天用生大蒜1公斤加食鹽0.5公斤，搗爛后加入10~20公斤精飼料喂服，或用磺胺胍粉10~20克與0.5公斤飼料拌勻后飼喂。以上兩法都可有效地預防草魚腸炎病的發生。

糞肥消毒

糞肥施用前，先在糞池中堆漚發酵半月以上，再在每1000公斤糞肥中，加0.5公斤漂白粉消毒后使用。