很多養殖戶在消毒過程中存在盲目性，致使消毒效果不理想，畜禽疾病照發，便認為消毒無用。為讓養殖戶正確認識消毒，充分發揮消毒效果，現將養雞生產中存在的消毒問題及解決辦法介紹如下：
　　消毒不全面
　　一般情況下對雞的消毒方法有三種，即帶雞（噴霧）消毒、飲水消毒和環境消毒。這三種消毒方法可分別切斷不同病原的傳播途徑，相互不能代替。帶雞消毒可殺滅空氣中、禽體表、地面及屋頂墻壁等處的病原體，對預防雞呼吸道疾病很有意義，還具有降低舍內氨氣濃度和防暑降溫的作用；飲水消毒可殺滅雞飲用水中的病原體并凈化腸道，對預防雞腸道病很有意義；環境消毒包括對禽場地面、門口過道及運輸車（料車、糞車）等的消毒。很多養殖戶認為，經常給雞飲消毒液，雞就不會得病。這是錯誤的認識，飲水消毒操作方法科學合理，可減少雞腸道病的發生，但對呼吸道疾病無預防作用，必須通過帶雞消毒來實現。因此，只有用上述３種方法共同給雞消毒，才能達到消毒目的。
　　消毒不勤
　　消毒是一項連續的防病工作，因此時間最好不間斷。帶雞消毒和飲水消毒的時間間隔如下：
　　帶雞消毒 育雛期一般第３周以后才可帶雞消毒（過早不但影響舍溫，而且如果頭兩周防疫做得不周密，會影響早期防疫），每２－３天消毒１次；育成期宜４－５天消毒１次；產蛋期宜１周消毒１次；發生疫情時每天消毒１次。疫苗接種前后２－３天不可帶雞消毒。
　　飲水消毒 育雛期最好第３周以后開始飲水消毒（過早不利雛雞腸道菌群平衡的建立，而且影響早期防疫）。飲水消毒有兩方面含義：第一，對飲水進行消毒，可防止通過飲水傳播疾病。這樣的消毒一般使用鹵素類消毒液，如漂白粉、氯制劑等，使用氯制劑時，應使有效氯濃度達３ｐｐｍ，或按消毒液說明書上要求的飲水消毒的濃度比的上限來配制，這樣濃度的消毒水可連續飲用。第二，凈化腸道，一般每周飲１－２次，每次２－３小時即可，濃度按照消毒液說明書上要求的飲水消毒的濃度比的下限來配制，（如標“飲水消毒１∶１０００－２０００”，可用１∶１０００來凈化腸道，每周飲１－２次；用１∶２０００來對飲水進行消毒，可連續飲用）。防疫前后３天、防疫當天（共７天）及用藥時，不可進行飲水消毒。
　　消毒液選擇不當
　　消毒液過于單一 總用一種消毒液容易使病菌產生耐藥性，同一批雞應交替使用２－３種消毒液。注意：應選擇不同成分而不是不同商品名的消毒液。市面上銷售的消毒液，很多是同藥異名。
　　消毒液無針對性 不同的消毒液對不同的病原體敏感性是不一樣的，一般病毒對含碘、溴、過氧乙酸的消毒液比較敏感，細菌對含雙鏈季銨鹽類的消毒液比較敏感。所以，在病毒多發的季節或雞生長階段（如冬春、肉雞３０日齡以后）應多用含碘、含溴的消毒液，而細菌病高發時（如夏季、肉雞３０日齡以前）應多用含雙鏈季銨鹽類的消毒液。
　　忽視了影響消毒的因素
　　溫度 一般情況下，消毒液溫度高，消毒效果可加大。實驗證明，消毒液溫度每提高１０℃，殺菌效力增加１倍，但配制消毒液的水溫不超過４５℃為好。另外，在熏蒸消毒時，需將舍溫提高到２０℃以上，才有較好的效果，否則效果不佳（舍溫低于１６℃時無效）。
　　濕度 很多消毒措施對濕度的要求較高，如熏蒸消毒時需將舍內濕度提高到６０－７０％，才有效果；生石灰單獨用于消毒是無效的，須灑上水或制成石灰乳等。
　　污物或殘料 灰塵、殘料（如蛋白質）等都會影響消毒液的消毒效果，尤其在進雛前消毒育雛用具時，一定要先清洗再消毒，不能清洗消毒一步完成，否則污物或殘料會嚴重影響消毒效果，使消毒不徹底。
　　消毒液的濃度和劑量 消毒液濃度并不是越高越好，濃度過高一是浪費，二會腐蝕設備，三還可能對雞造成危害。另外，有些消毒藥濃度過高反而會使消毒效果下降，如酒精在７５％時消毒效果最好。消毒液用量方面，在噴霧消毒時按每立方米空間３０毫升為宜，太大會導致舍內過濕，用量小又達不到消毒效果。一般應靈活掌握，在雞群發病、育雛前期、溫暖天氣等情況下應適當加大用量，而天氣冷、肉雞育雛后期用量應減少。