在孵化條件正常的情況下，胚胎死亡的分布比較有規律。從曲線可以看出有兩個死亡高峰，第一次是在孵化的3-5天，死胚數占全部死胚的15%；第二次是在孵化的18-20天,死胚數占全部死胚的50%。

高孵化率雞群，雞胚多死于第二高峰；而低孵化率雞群，兩個高峰死亡率大致相似，第二高峰稍高。 第一死亡高峰正是胚胎生長迅速、各種胚膜相繼形成但尚未完善之時，胚胎對外界環境變化很敏感。第二死亡高峰則處于胚胎從尿囊絨毛膜呼吸，過渡到肺呼吸時期。此時胚胎生理變化劇烈，需氧量劇增，自溫猛增，傳染性胚胎病的威脅更突出，對孵化環境要求高，一些較弱的胚胎不能順利破殼而死亡。

胚胎死亡與維生素缺乏有密切關系，從而影響孵化性能，并且影響雛雞質量及育雛前期的成活率和雛雞發育，應當引起高度關注。

胚胎缺乏維生素A時，胚胎異位的發生率提高，循環系統發育異常。胚胎可能在孵化期第一周內死亡，或可存活到孵化期結束但無力出殼，或者雖然可以出殼但會很快死亡。如母雞體內缺乏VA，雛雞在出殼后1周左右即出現癥狀。檢測發現，健雛比弱雛肝臟中VA的含量能高3倍以上。

母雞體內維生素D儲存量不足時，導致雛雞發育遲緩和軟骨癥，表現育雛期癱雞和腿病。通常伴有蛋殼品質降低如蛋殼空隙改變等。檢測發現，健雛比弱雛肝臟中VD的含量能高2倍以上。試驗表明，給種雞添加25-羥基維生素D3，能夠促進胚胎發育和提高孵化率； 育雛期有效預防癱雞，可減少雛雞死亡率1-3%。

VE缺乏，1-3天胚胎早期死亡，可見腦軟化和滲出性素質。雛雞需要較高的VE，出殼前幾天的需要通過種雞轉化給它，檢測發現，健雛比弱雛肝臟中VE的含量能高2倍多。育雛期要注意補充VE。

維生素K缺乏，雛雞出殼時出血、流血，1日齡雛雞斷喙時出血過多。

硫胺素（B1）缺乏，出現兩個階段性胚胎死亡，一個在早期，另一個在19-21天。落盤時雛雞大批死亡，但畸形雞很少。出殼10-14天的雞死亡率較高，雛雞注射硫胺素后很快使病情得到好轉。一些消毒劑、抗球蟲劑和劣質魚粉會加劇硫胺素的缺乏。最近的研究證明，當某些鐮刀霉菌存在時，霉菌對維生素B1（硫胺素）的利用和破壞容易造成硫胺素的缺乏，硫胺素的需要量提高。

生物素是保持胚胎正常發育及孵化率所必須的，蛋內缺乏生物素會導致孵化的第一、第三周的死胚率有所增加，外補充生物素可解決蛋內缺乏問題。缺乏生物素主要是降低孵化率，但對產蛋影響不大，孵化第一周出現胚胎死亡率高峰并持續3天。日糧中生物素不足或缺乏，將導致孵化前5天或17天后的死亡高峰有所增加，軟骨營養障礙或短肢，短骨及鸚鵡喙等，可見骨骼畸形和喙彎曲。

核黃素（B2）缺乏，9-14或17-21天胚胎大量死亡，胚胎出現水腫和\或棍狀絨毛，雛雞爪極度彎曲。

葉酸缺乏或不足可導致的胚胎發育畸形甚至死亡。補充添加葉酸可提高蛋重及出殼重，同時種蛋貯存期延長會導致胚胎缺乏葉酸。

維生素B12缺乏，約8-14天出現胚胎死亡，常伴有水腫、曲爪和短喙。

泛酸缺乏，未出殼的雛雞皮下出血。

種雞維生素充足，孵化好的情況下，入孵蛋孵化率可高達87%，受精蛋孵化率可高達92%，健雛率可高達98%，無精蛋不超過4-5%，頭照死胚低于2%，二照死胚低于2-3%，移盤后死胚低于6-7%。