霉菌毒素的影響 幾乎所有的霉菌毒素都對免疫系統有破壞作用，使豬的免疫系統不足以抑制病原體的侵害，為疾病的發生創造了有利條件；霉菌毒素能導致豬產生免疫抑制，引起免疫失敗，導致疫病傳播。

免疫抑制性疾病的影響 常見疾病如豬繁殖和呼吸道綜合征(PRRS)及圓環病毒等在豬群存在，會產生免疫抑制，使豬的免疫力下降，肌體對豬瘟疫苗的免疫應答下降，造成免疫失敗。

免疫程序不合理 免疫程序的關鍵是排除母源抗體干擾，確定合理的首免日齡。有的豬場忽視本場的實際以及豬個體的差異，采用同一個免疫程序來進行免疫，如在母源抗體效價尚高時接種疫苗，即會被母源抗體中和掉部分弱毒，阻礙疫苗弱毒的復制，子豬就不能產生堅強的主動免疫力。

疫苗免疫劑量不足 對于那些處于半免疫狀態的臨床感染的豬(無臨床癥狀)，若此時僅接種1頭份豬瘟活疫苗，非但不能產生免疫力，反而刺激引發非典型豬瘟。

疫苗質量問題 疫苗的運輸、保存、使用不當，會影響免疫效果。豬瘟凍干苗應在低溫條件下運輸和保存，稀釋后應立即使用，不能存放過久。此外，操作過程中的失誤，如用失真空的疫苗或超過有效期的疫苗，注射時消毒不嚴，造成潛伏期病毒的傳播等，都會影響疫苗的免疫效果。另一方面，不法廠家私自制造一些質量沒有保證的豬瘟疫苗，獸醫從業人員的素質水平普遍較低，使豬免疫失敗和患隱性豬瘟的豬增多。