重大疫病時刻困擾著養豬產業，多重感染、混合感染已成為我國規模化豬場的普遍現象（尤其是豬呼吸道疾病綜合癥），診斷和確定各種原發病原感染的時間先后很困難，為疫病防控帶來難題。實驗室已診斷出多種病原，包括豬瘟病毒、豬繁殖與呼吸綜合癥病毒、豬環狀病毒、副豬嗜血桿菌、豬肺炎支原體、豬鏈球菌、多殺性巴氏桿菌、偽狂犬病毒、豬流感病毒、胸膜肺炎放線桿菌等，其中豬繁殖與呼吸綜合癥病毒、豬肺炎支原體和副豬嗜血桿菌是最常被分離到的病原，保育豬群發病最嚴重。為控制多重感染，少數大型豬場引進國外新技術如多點式飼養、早期隔離斷奶、分胎次飼養、二次保育等收到良好效果。大多數豬場依然一籌莫展，甚至對健康養殖失去信心，使用各種優質疫苗和藥物保健手段、免疫補強也難以濟事。

豬場有如此嚴重的發病隱患，原因有三點：第一是整個飼養管理、環境管理不到位，粗放的管理給豬帶來太多應激；第二是霉菌毒素對豬的影響面廣量大，使豬失去抵抗力；第三是種豬帶病引進了新病原或周圍有感染壓力導致發病。

要解決這種問題，最有效的手段就是加強管理。有很多例證已經表明：同樣的豬、同樣的疾病背景，只要管理好就不會發病，無論是副豬嗜血桿菌病、藍耳病還是圓環病毒感染。所以，混合感染的控制核心就是加強管理，通過管理改善環境、保證營養和生物安全。

疫苗和藥物的亂用、濫用、誤用必須通過嚴格管理糾正，杜絕不規范使用藥品。豬場須建立一套規范的管理制度，把養豬生產流程中的關鍵控制點總結出來，根據這些關鍵點培訓員工，使員工能夠根據這些關鍵點進行標準化操作，使豬在生產過程中少受或不受應激，這樣對豬病控制成效顯著。在養豬過程中，要時刻關注豬的動態，規模化豬場要求每年進行4次血清學檢測，主要是豬瘟、豬偽狂犬病的抗體檢測，如有呼吸道疾病還要對弓形蟲進行檢測。一般豬場可通過精細化管理堵漏，真正解決管理問題必須通過生產水平數據分析。