菖蒲喜陰好濕，從這點講水養比泥栽為佳，但水養時只能浸根，不可浸葉，最好將其置于花陰之中，使其承風受露，又勿使日光曝曬。入夏氣候炎熱，除有來客觀賞外，應將石菖蒲水盆終日置于花陰間，避免炎熱消耗養分。　　水養最好是大塊老根，以老根高出泥面蜿蜒如龍行者最佳，但不易覓得。零星的小株菖蒲可將之糾結成團，再以棕櫚皮包裹放置水盆之中即可，但小株菖蒲根須甚短，成團、包裹均不易，可用漆包線將這些石菖蒲連串成團（注意：不可傷其老根），再在四周用漆包線圍上數圈，雖經水浸石壓也不易脫散。